Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RFTN2Q52LD8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms