Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf46Q504U0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf46Q504U0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms