Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF212Q495C1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms