Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSPP1Q1MSJ5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSPP1Q1MSJ5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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