Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPP1Q16831 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UPP1Q16831 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms