Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACKR1Q16570 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACKR1Q16570 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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