Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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VAMP3Q15836 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAMP3Q15836 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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