Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NBR1Q14596 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
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