Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NEUROD1Q13562 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
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