Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA4Q13439 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA4Q13439 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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