Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
PRDM2Q13029 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PRDM2Q13029 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
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