Protein–RNA interactions for Protein: Q12250

RPN5, 26S proteasome regulatory subunit RPN5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN5Q12250 PRE1YER012W 597 nt2.51□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 GLC7YER133W 939 nt2.51□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 YGR050CYGR050C 357 nt2.51□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 PEX18YHR160C 852 nt2.51□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 CKA1YIL035C 1119 nt2.51□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 YKL066WYKL066W 444 nt2.51□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 SDS22YKL193C 1017 nt2.51□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 MED8YBR193C 672 nt2.51□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 YPL216WYPL216W 3309 nt2.51□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 YLR001CYLR001C 2589 nt2.51□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 YCR099CYCR099C 468 nt2.5□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 GPI14YJR013W 1212 nt2.5□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 VPH2YKL119C 648 nt2.5□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.5□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 PSD2YGR170W 3417 nt2.5□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 FKS3YMR306W 5358 nt2.5□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 HOS4YIL112W 3252 nt2.5□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 TIF35YDR429C 825 nt2.49□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 MPO1YGL010W 525 nt2.49□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 YGR242WYGR242W 309 nt2.49□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 FYV4YHR059W 393 nt2.49□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 HRD3YLR207W 2502 nt2.49□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 SEC26YDR238C 2922 nt2.49□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 ORC2YBR060C 1863 nt2.49□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 AYT1YLL063C 1425 nt2.49□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 VPS64YDR200C 1815 nt2.49□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 YNL018CYNL018C 1839 nt2.49□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 RPN3YER021W 1572 nt2.49□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 NFT1YKR103W 3657 nt2.48□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 JIP5YPR169W 1479 nt2.48□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 SYS1YJL004C 612 nt2.48□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 YMR187CYMR187C 1296 nt2.48□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 MIX23YBL107C 591 nt2.48□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 KRE33YNL132W 3171 nt2.48□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 TCB2YNL087W 3537 nt2.48□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 IRA2YOL081W 9240 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 HAA1YPR008W 2085 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 RSM18YER050C 417 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 NBP1YLR457C 960 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 YOR169CYOR169C 465 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 ACM1YPL267W 630 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 YPL276WYPL276W 438 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 RGA2YDR379W 3030 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 YIL080WYIL080W 4722 nt2.47□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 INP51YIL002C 2841 nt2.46□□□□□ -2.01
RPN5Q12250 NCS2YNL119W 1482 nt2.46□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 TDA2YER071C 381 nt2.46□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt2.46□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 EDS1YBR033W 2760 nt2.45□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 PRE8YML092C 753 nt2.45□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YOL150CYOL150C 312 nt2.45□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.45□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YPR089WYPR089W 2667 nt2.45□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 SRO77YBL106C 3033 nt2.45□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 GDI1YER136W 1356 nt2.45□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 HSC82YMR186W 2118 nt2.45□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 SNF12YNR023W 1701 nt2.45□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 RTT10YPL183C 3042 nt2.44□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 ROY1YMR258C 1662 nt2.44□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 GIN4YDR507C 3429 nt2.44□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 SGM1YJR134C 2124 nt2.44□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 GPM2YDL021W 936 nt2.44□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YFL012WYFL012W 447 nt2.44□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YGR293CYGR293C 462 nt2.44□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YNL046WYNL046W 519 nt2.44□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 OST2YOR103C 393 nt2.44□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YBR063CYBR063C 1215 nt2.44□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 MRD1YPR112C 2664 nt2.44□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 KSP1YHR082C 3090 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 PRP6YBR055C 2700 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 SKP2YNL311C 2292 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 INP53YOR109W 3324 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 FAR7YFR008W 666 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 MND1YGL183C 660 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 SDL1YIL167W 633 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YNL050CYNL050C 813 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 KTI11YBL071W-A 249 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YNL235CYNL235C 432 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YPR170CYPR170C 336 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 TRS130YMR218C 3309 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 SHE4YOR035C 2370 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 snR59snR59 78 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YDR115WYDR115W 318 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YLR224WYLR224W 1110 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 GIM3YNL153C 390 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 NSL1YPL233W 651 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 ARR2YPR200C 393 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YBR197CYBR197C 654 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 RSE1YML049C 4086 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 LEU3YLR451W 2661 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 PSO2YMR137C 1986 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 ARP8YOR141C 2646 nt2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 75.7 ms