Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC173Q0VFZ6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms