Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABPAQ06546 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABPAQ06546 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms