Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNB1Q02641 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNB1Q02641 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms