Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms