Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CDKL1Q00532 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms