Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIM1P81133 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIM1P81133 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIM1P81133 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIM1P81133 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIM1P81133 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIM1P81133 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIM1P81133 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIM1P81133 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIM1P81133 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIM1P81133 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIM1P81133 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIM1P81133 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIM1P81133 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIM1P81133 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIM1P81133 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIM1P81133 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIM1P81133 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIM1P81133 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SIM1P81133 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms