Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX3P78415 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX3P78415 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX3P78415 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX3P78415 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX3P78415 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX3P78415 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX3P78415 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX3P78415 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX3P78415 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX3P78415 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX3P78415 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX3P78415 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX3P78415 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX3P78415 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX3P78415 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX3P78415 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX3P78415 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX3P78415 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX3P78415 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX3P78415 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX3P78415 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX3P78415 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX3P78415 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX3P78415 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX3P78415 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IRX3P78415 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX3P78415 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX3P78415 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX3P78415 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX3P78415 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX3P78415 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX3P78415 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX3P78415 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX3P78415 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX3P78415 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX3P78415 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX3P78415 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms