Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GPC5P78333 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC5P78333 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC5P78333 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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GPC5P78333 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC5P78333 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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GPC5P78333 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC5P78333 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC5P78333 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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GPC5P78333 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC5P78333 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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GPC5P78333 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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GPC5P78333 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC5P78333 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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GPC5P78333 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC5P78333 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC5P78333 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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GPC5P78333 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC5P78333 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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