Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HERVK_113P62684 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HERVK_113P62684 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms