Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2FP61218 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.5 ms