Protein–RNA interactions for Protein: P58005

SESN3, Sestrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESN3P58005 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SESN3P58005 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SESN3P58005 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SESN3P58005 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SESN3P58005 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SESN3P58005 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SESN3P58005 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SESN3P58005 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SESN3P58005 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SESN3P58005 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SESN3P58005 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SESN3P58005 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SESN3P58005 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SESN3P58005 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SESN3P58005 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SESN3P58005 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SESN3P58005 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SESN3P58005 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SESN3P58005 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SESN3P58005 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SESN3P58005 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SESN3P58005 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SESN3P58005 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SESN3P58005 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SESN3P58005 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SESN3P58005 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms