Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSDMDP57764 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms