Protein–RNA interactions for Protein: P55318

FOXA3, Hepatocyte nuclear factor 3-gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXA3P55318 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXA3P55318 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms