Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2A2P52657 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms