Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SMARCA4P51532 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms