Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCNN1GP51170 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNN1GP51170 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms