Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRP9P49458 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRP9P49458 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRP9P49458 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRP9P49458 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRP9P49458 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRP9P49458 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRP9P49458 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRP9P49458 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRP9P49458 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRP9P49458 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRP9P49458 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRP9P49458 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRP9P49458 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRP9P49458 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRP9P49458 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRP9P49458 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRP9P49458 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRP9P49458 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRP9P49458 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRP9P49458 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRP9P49458 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRP9P49458 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms