Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACADSBP45954 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms