Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.27□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 RPS22BYLR367W 393 nt2.27□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 CSI2YOL007C 1026 nt2.27□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YPR014CYPR014C 330 nt2.27□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 SPP41YDR464W 4308 nt2.26□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 SEC31YDL195W 3822 nt2.26□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.26□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 UBC12YLR306W 567 nt2.26□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 RSA1YPL193W 1146 nt2.26□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YCL023CYCL023C 348 nt2.26□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 NUP100YKL068W 2880 nt2.26□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 HRD3YLR207W 2502 nt2.26□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 NOP14YDL148C 2433 nt2.26□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 MCD1YDL003W 1701 nt2.25□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 INP51YIL002C 2841 nt2.25□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 SLK19YOR195W 2466 nt2.25□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YCT1YLL055W 1596 nt2.25□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.25□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YMR31YFR049W 372 nt2.25□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 BRP1YGL007W 378 nt2.25□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YLR198CYLR198C 360 nt2.25□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 IRC21YMR073C 606 nt2.25□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 RPL36AYMR194W 303 nt2.25□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YMR320WYMR320W 306 nt2.25□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 ATX1YNL259C 222 nt2.25□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 GRE2YOL151W 1029 nt2.25□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 TWF1YGR080W 999 nt2.24□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 RTS3YGR161C 792 nt2.24□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 VPH2YKL119C 648 nt2.24□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 RRT16YNL105W 429 nt2.24□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YAP7YOL028C 738 nt2.24□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 CSF1YLR087C 8877 nt2.24□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 HSC82YMR186W 2118 nt2.24□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 NPR3YHL023C 3441 nt2.23□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 CAJ1YER048C 1176 nt2.23□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YFR057WYFR057W 456 nt2.23□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 GEP7YGL057C 864 nt2.23□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 UTP30YKR060W 825 nt2.23□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 ESF2YNR054C 951 nt2.23□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 PEX27YOR193W 1131 nt2.23□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 SPR2YOR214C 711 nt2.23□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 RRP15YPR143W 753 nt2.23□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 snR24snR24 89 nt2.23□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 COG3YER157W 2406 nt2.23□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 PUF4YGL014W 2667 nt2.23□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YDR338CYDR338C 2088 nt2.22□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 ALY1YKR021W 2748 nt2.22□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 RLF2YPR018W 1821 nt2.22□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 SLU7YDR088C 1149 nt2.22□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 HTB1YDR224C 396 nt2.22□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 COX6YHR051W 447 nt2.22□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 RNP1YLL046C 750 nt2.22□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 NEJ1YLR265C 1029 nt2.22□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 SPC2YML055W 537 nt2.22□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YOL106WYOL106W 354 nt2.22□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 UTP5YDR398W 1932 nt2.22□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 AFI1YOR129C 2682 nt2.22□□□□□ -2.05
SHQ1P40486 YPR097WYPR097W 3222 nt2.21□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 STI1YOR027W 1770 nt2.21□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 SNA4YDL123W 423 nt2.21□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 CBS2YDR197W 1170 nt2.21□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 EMP24YGL200C 612 nt2.21□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 VMA7YGR020C 357 nt2.21□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 RPL11BYGR085C 525 nt2.21□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 IKI1YHR187W 930 nt2.21□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 MGE1YOR232W 687 nt2.21□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 ATG11YPR049C 3537 nt2.21□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 RPL11AYPR102C 525 nt2.21□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 SEC66YBR171W 621 nt2.21□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 KSP1YHR082C 3090 nt2.21□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 PSK2YOL045W 3306 nt2.2□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 BFR1YOR198C 1413 nt2.2□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 RGA2YDR379W 3030 nt2.2□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YDR262WYDR262W 819 nt2.2□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 MPO1YGL010W 525 nt2.2□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 TPK3YKL166C 1197 nt2.2□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 RGM1YMR182C 636 nt2.2□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YOR097CYOR097C 528 nt2.2□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 ARL1YBR164C 552 nt2.2□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 GYP5YPL249C 2685 nt2.2□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 NEO1YIL048W 3456 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YCR100CYCR100C 951 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 RAV2YDR202C 1056 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 BTN2YGR142W 1233 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 PAU8YAL068C 363 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 ECI1YLR284C 843 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 DCP1YOL149W 696 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 PAU20YOL161C 363 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 MBA1YBR185C 837 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 KAP123YER110C 3342 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 GDI1YER136W 1356 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 SSP1YHR184W 1716 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YRR1YOR162C 2433 nt2.19□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 SAG1YJR004C 1953 nt2.18□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YDL157CYDL157C 357 nt2.18□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 RMD6YEL072W 696 nt2.18□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.18□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.8 ms