Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXC8P31273 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC8P31273 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms