Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD34P28906 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD34P28906 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD34P28906 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CD34P28906 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CD34P28906 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CD34P28906 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CD34P28906 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CD34P28906 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CD34P28906 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD34P28906 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms