Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms