Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACO1P21399 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACO1P21399 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACO1P21399 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACO1P21399 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACO1P21399 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACO1P21399 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACO1P21399 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACO1P21399 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACO1P21399 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACO1P21399 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACO1P21399 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACO1P21399 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACO1P21399 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACO1P21399 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACO1P21399 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACO1P21399 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACO1P21399 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACO1P21399 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACO1P21399 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACO1P21399 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACO1P21399 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACO1P21399 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACO1P21399 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACO1P21399 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ACO1P21399 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACO1P21399 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACO1P21399 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACO1P21399 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms