Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARF4P18085 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARF4P18085 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF4P18085 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF4P18085 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF4P18085 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF4P18085 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF4P18085 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF4P18085 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF4P18085 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF4P18085 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARF4P18085 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARF4P18085 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARF4P18085 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF4P18085 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF4P18085 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF4P18085 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF4P18085 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF4P18085 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF4P18085 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF4P18085 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF4P18085 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF4P18085 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF4P18085 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF4P18085 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF4P18085 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF4P18085 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF4P18085 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF4P18085 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF4P18085 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF4P18085 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF4P18085 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF4P18085 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF4P18085 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF4P18085 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF4P18085 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF4P18085 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF4P18085 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF4P18085 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF4P18085 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF4P18085 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF4P18085 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF4P18085 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF4P18085 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF4P18085 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF4P18085 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF4P18085 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF4P18085 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF4P18085 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF4P18085 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF4P18085 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms