Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSP16219 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSP16219 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSP16219 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ACADSP16219 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ACADSP16219 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSP16219 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSP16219 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSP16219 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSP16219 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSP16219 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSP16219 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSP16219 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSP16219 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSP16219 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ACADSP16219 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSP16219 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSP16219 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSP16219 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSP16219 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSP16219 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSP16219 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSP16219 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSP16219 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSP16219 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSP16219 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSP16219 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSP16219 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSP16219 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ACADSP16219 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ACADSP16219 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ACADSP16219 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ACADSP16219 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ACADSP16219 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ACADSP16219 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSP16219 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSP16219 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms