Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MUC1P15941 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MUC1P15941 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MUC1P15941 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MUC1P15941 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MUC1P15941 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MUC1P15941 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MUC1P15941 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MUC1P15941 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MUC1P15941 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MUC1P15941 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MUC1P15941 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MUC1P15941 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MUC1P15941 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MUC1P15941 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MUC1P15941 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MUC1P15941 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MUC1P15941 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MUC1P15941 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MUC1P15941 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MUC1P15941 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MUC1P15941 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MUC1P15941 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MUC1P15941 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MUC1P15941 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MUC1P15941 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MUC1P15941 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MUC1P15941 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MUC1P15941 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MUC1P15941 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MUC1P15941 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MUC1P15941 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms