Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXB3P14651 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms