Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRF1P14222 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRF1P14222 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRF1P14222 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRF1P14222 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRF1P14222 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRF1P14222 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRF1P14222 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRF1P14222 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRF1P14222 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms