Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD8P13378 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms