Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP2C9P11712 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP2C9P11712 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP2C9P11712 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP2C9P11712 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP2C9P11712 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP2C9P11712 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP2C9P11712 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP2C9P11712 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP2C9P11712 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP2C9P11712 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP2C9P11712 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP2C9P11712 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms