Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI3P10071 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI3P10071 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GLI3P10071 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GLI3P10071 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI3P10071 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GLI3P10071 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GLI3P10071 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GLI3P10071 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI3P10071 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI3P10071 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI3P10071 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GLI3P10071 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GLI3P10071 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GLI3P10071 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GLI3P10071 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLI3P10071 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GLI3P10071 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLI3P10071 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GLI3P10071 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GLI3P10071 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GLI3P10071 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GLI3P10071 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GLI3P10071 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI3P10071 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI3P10071 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GLI3P10071 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GLI3P10071 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GLI3P10071 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI3P10071 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI3P10071 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI3P10071 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI3P10071 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GLI3P10071 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GLI3P10071 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
GLI3P10071 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■■□□ 2
GLI3P10071 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GLI3P10071 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI3P10071 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI3P10071 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI3P10071 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI3P10071 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI3P10071 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI3P10071 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI3P10071 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI3P10071 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI3P10071 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GLI3P10071 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI3P10071 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI3P10071 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI3P10071 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI3P10071 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI3P10071 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI3P10071 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI3P10071 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI3P10071 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI3P10071 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI3P10071 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI3P10071 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI3P10071 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI3P10071 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI3P10071 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI3P10071 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI3P10071 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI3P10071 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI3P10071 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI3P10071 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI3P10071 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI3P10071 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI3P10071 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GLI3P10071 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GLI3P10071 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms