Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL2A1P02458 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL2A1P02458 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms