Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EGFRP00533 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EGFRP00533 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EGFRP00533 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EGFRP00533 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EGFRP00533 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EGFRP00533 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EGFRP00533 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFRP00533 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFRP00533 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFRP00533 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFRP00533 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFRP00533 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFRP00533 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFRP00533 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFRP00533 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFRP00533 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFRP00533 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFRP00533 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EGFRP00533 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFRP00533 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFRP00533 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFRP00533 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFRP00533 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFRP00533 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFRP00533 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFRP00533 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFRP00533 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFRP00533 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFRP00533 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFRP00533 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFRP00533 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EGFRP00533 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFRP00533 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFRP00533 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFRP00533 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFRP00533 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFRP00533 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFRP00533 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFRP00533 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFRP00533 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFRP00533 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFRP00533 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EGFRP00533 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EGFRP00533 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFRP00533 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFRP00533 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFRP00533 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFRP00533 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFRP00533 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFRP00533 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFRP00533 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFRP00533 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFRP00533 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFRP00533 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFRP00533 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFRP00533 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EGFRP00533 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms