Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHOBTB3O94955 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOBTB3O94955 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms