Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MSCO60682 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSCO60682 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MSCO60682 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MSCO60682 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MSCO60682 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSCO60682 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MSCO60682 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSCO60682 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSCO60682 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSCO60682 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSCO60682 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSCO60682 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSCO60682 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSCO60682 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MSCO60682 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSCO60682 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSCO60682 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSCO60682 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSCO60682 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MSCO60682 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSCO60682 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSCO60682 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSCO60682 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSCO60682 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSCO60682 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSCO60682 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSCO60682 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSCO60682 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSCO60682 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSCO60682 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSCO60682 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSCO60682 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSCO60682 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSCO60682 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSCO60682 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSCO60682 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MSCO60682 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms