Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F3O00716 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F3O00716 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F3O00716 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F3O00716 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F3O00716 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F3O00716 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms