Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF5O00463 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms