Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3BQV1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3BQV1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3BQV1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3BQV1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H3BQV1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H3BQV1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3BQV1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BQV1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BQV1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BQV1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BQV1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BQV1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BQV1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BQV1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BQV1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BQV1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BQV1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms